1959年4月以钟楼钢铁医院为基础组建钟楼区人民医院，属全民所有制，院址设在常州卧龙湾桥，工作人员共四十人，门诊设内科、外科、五官科、中医科和产科，医技科室有X线、化验室、病房床位申报五十张。
1961年10月撤销钟楼区西仓分院，人员并入钟楼区医院。
1962年钟楼区人民医院体制下放，更名为钟楼区医院，体制属集体所有制。撤销荷花池公社医院，人员并入区医院。
1965年6月25日，钟楼区南河沿中西联合诊所撤销，人员并入钟楼区医院。
1970年4月，由胜利医院，工农兵医院（又称怀德医院）、口腔医院三个单位合并成立常州市胜利区医院。迁移院址到北直街119号。
1980年1月1日，恢复钟楼区医院。
1985年1月1日，经常州市人民政府批准成立常州市口腔医院，与钟楼区医院挂两块牌子，一套领导班子。
2008年6月19日，根据常州市政府对卫生资源统一优化部署，医院与常州市中医医院资源整合，实行一体化管理，更名：常州市口腔医院，常州市中医医院钟楼院区。
